瓠瓜作为重要的葫芦科作物之一，在我国已有悠久的栽培历史。瓠瓜分子标记研究大大落后于黄 瓜、白菜等作物，应用分子标记技术开展瓠瓜种质资源的遗传多样性和亲缘关系研究，对促进瓠瓜重要种质资 源的开发和利用具有重要意义。本研究选择96 份具有广泛代表性的我国瓠瓜种质材料，利用插入/缺失分子标 记技术，研究分析了其遗传多样性和亲缘关系，探讨我国瓠瓜品种间的基因差异和瓠瓜亚种间及亚种内的亲缘 关系。结果表明，瓠瓜种质遗传相似系数0. 30 ～ 1. 00，在遗传相似系数0. 68 处可将96 份瓠瓜种质材料分为8 类，各种质材料分布较平均; 相同瓜型的材料有聚集在一起的趋势，根据瓜型可将这96 份瓠瓜种质大致分为 3 类。